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パーミッション とは、許諾という意味の英単語で、UNIX系OSでは ファイルシステム 上でファイルや ディレクトリ などに設定されるユーザーやユーザーグループごとのアクセス許諾（ アクセス権 ）を指す。
出典「ロリポップ」より

ようは、ファイルに色んな存在からアクセスされた時に、どこまで許す（許可する）かを決めているものです。
FTPソフトを使用すると、大概わかりやすいかたちで表示されます。

大概「rwxr-xr-x」などと表示されます。
ｒは「readable」読み込み許可です。数値では４を表します。
ｗは「writable」書き込み許可です。数値では２を表します。
ｘは「executable」実行許可です。数値では１を表します。

他にパーミッションは、「オーナー」、「グループ」、「その他」でアクセス許可を決めていきます。
オーナー：所有者本人
グループ：所有者本人が所属するグループ
その他：アクセスしてきた人たち

例えば、CGIは７０５、もしくは７５５にパーミッションを設定してください。と言われたら、FTPアプリ上で、そのように変更します。

「７０５」は、７はオーナーを表し、読み込み、書き込み、実行許可がOKになっていて、上記数値を合計すると７になります。
０は、グループを表し、読み込み、書き込み、実行許可がNOです。数値はすべて足しても０（ゼロ）なわけです。
最後の５はその他を表し、読み込みと実行はOKで書き込みがNOです。数値を足すと５になります。